O CTM-Sudeste visa a capacitação para o trabalho missonário de IMPLANTAÇÃO E REVITALIZAÇÃO DE IGREJAS EM CENTROS URBANOS e para liderança e atuação evangelístico-missionária em IGREJAS LOCAIS.
O CTM-Sudeste desenvolve, ainda, programas adequadros aos diferentes tipos de treinamento e formação de membros das igrejas locais, permitindo assim que irmãos e irmãs cursem a grade completa de disciplinas ou apenas disciplinas avulsas, ensejando seu aperfeiçoamento missiolígico, bíblico e teológico.